3048 yılında (Zaman mefhumu yok,filmin kendi tematiği içerisinde 3048 yılı izleyici için bir anlam ifade etmiyor) Lord Kagemitsu Daigo, dünyayı yönetme hakkı karşılığında iblislerle bir anlaşma yapar. Anlaşmaya göre Daigo,henüz doğmamış oğlununun 48 parçasını 48 iblise hediye edecektir. Anlaşma yüzü
... Devamı 3048 yılında (Zaman mefhumu yok,filmin kendi tematiği içerisinde 3048 yılı izleyici için bir anlam ifade etmiyor) Lord Kagemitsu Daigo, dünyayı yönetme hakkı karşılığında iblislerle bir anlaşma yapar. Anlaşmaya göre Daigo,henüz doğmamış oğlununun 48 parçasını 48 iblise hediye edecektir. Anlaşma yüzünden çocuk sadece bir kafa ve gövdeden ibaret kalır. Daigo’nun eşi oğlunun canının kalanını korumak için onu bir sepet içinde nehre bırakır.
Çocuk şaşırtıcı bir şekilde hayatta kalır ve iblis avcısı Hyakkimaru haline gelir. Hyakkimaru avladığı her iblis için bir parçasını geri almaktadır. Günün birinde kız hırsız Dororo (iblis çocuk anlamına geliyor) ile tanışınca işler daha da karışacaktır. Dororo ailesinin katili olan Daigo’dan intikam almak için çıktığı yolculuğunu Daigo klanının en büyük utancı Hyakkimaru sayesinde tamamlamayı planlamaktadır.